台湾地区流行疫情指挥中心1月3日公布，台湾出现首例奥密克戎毒株本土感染病例。该病例在台北市中正区的一家防疫旅馆被发现。目前，在该旅馆共出现3起奥密克戎确诊病例。其中一人从美国前往台湾地区，疑为病毒传播源头。另外两人分别从大陆和日本前往台湾地区。

台湾地区流行疫情指挥中心指挥官陈时中表示，不排除病毒是通过空调系统传播的，也可能是旅馆的清洁消毒没有做好，导致三人交叉感染。台湾地区流行疫情指挥中心遂决定将这两起病例改列为本土病例，台湾地区也因此出现首例奥密克戎本土感染病例。去年12月11日，台湾地区出现首例奥密克戎毒株感染病例。该病例为输入病例，12月8日进入台湾地区后，新冠病毒检测结果为阴性。12月9日在集中检疫所检测结果呈阳性，收治于医院负压隔离病房。12月11日病毒测序确定其为奥密克戎毒株感染病例，属无症状感染者。